Ecossistema é a base funcional da Ecologia. Refere-se a um sistema de organismos vivos que interagem não só com o meio físico que os rodeia mas também com a química ambiental e com o meio social e biológico em que estão inseridos. Ecossistema implica que os organismos e o seu meio formam um todo, apesar de cada um ser um ser individual.
O Pantanal é considerado a maior planície continua inundável do mundo, com 140 mil quilômetros quadrados. O Pantanal é parte da Bacia do Alto Paraguai (BAP). A BAP é formada por uma extensão aproximada de 600.000 km2 mil, dos quais 61% encontram-se no Brasil, 20% na Bolívia e 19% no Paraguai. No Brasil, a bacia abrange parte dos estados de Mato Grosso e Mato Grosso do Sul.